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不过，学术查重并非能甄别全部的引用文献，只有某些相符合格式的引用文献才会被学术甄别，这也就说明只有当引用文献格式规范且准确的时候，学术才能将该部分引用文献排除在查重范畴以外。
所以，能够肯定的说，学术查重不包括格式准确的引用文献。另，为什么学术查重报告文档当中一些时候会将引用文献标红呢？这有以下2种原因，即一是可能论文编者选用不正规的的学术查重系统对文章来查重，而这些不正规的的学术查重系统并不正规的的学术查重，故而无法甄别引用文献，引起引用文献飘红；二是论文的引用文献格式不精准，引起学术查重系统无法甄别该部分引用文献，进而将该引用文献标红，实际上，若该部分引用文献格式准确就会被学术查重甄别，进而是不会揽入查重范畴以内。
综上所述，学术查重并不包括引用文献，学术查重一般来说只对论文的摘录部分、英文摘录部分、内容部分及附录部分来查重，而引用文献并不会在学术查重范畴以内。所以，论文编者不用担心因要用到罗列非常多的引用文献在论文当中。
但，唯有专业的学术才会甄别引用文献，而且其有的一个前置性要求就是引用文献格式准确，这也说明论文编者务必到学术不端网的“学术查重入口”等专业的学术查重网站来查重，且要通过规定创写引用文献，保障学术能甄别。